在胚胎發(fā)育的最早期階段,血管和血細(xì)胞是由共同的祖細(xì)胞形成的。在一種遺傳程序中,血液和血管形成的時(shí)機(jī)和方式受到多種基因的調(diào)節(jié)。這種遺傳程序的特征是類(lèi)似級(jí)聯(lián)反應(yīng)的基因活性激活模式。
Reischauer說(shuō),在上世紀(jì)90年代中期,那時(shí)Stainier還在美國(guó),他就發(fā)現(xiàn)模式生物斑馬魚(yú)的一種突變體“擁有迄今為止發(fā)現(xiàn)的最為令人關(guān)注的發(fā)育缺陷之一”。由于這種斑馬魚(yú)發(fā)生一種基因變化,參與血細(xì)胞和血管細(xì)胞遺傳程序的多種基因沒(méi)有一種被激活。因此,這些細(xì)胞不能夠產(chǎn)生。因?yàn)檫@種斑馬魚(yú)突變體的另一種獨(dú)特的特征:類(lèi)似鐘形女帽(cloche)的心臟形狀,Stainier將它稱(chēng)作為clothe。
在過(guò)去的二十年中,世界各地的許多實(shí)驗(yàn)室參與尋找導(dǎo)致這種斑馬魚(yú)突變體產(chǎn)生的基因。Reischauer說(shuō),“對(duì)我們所有人來(lái)說(shuō),鑒定出Cloche基因就像是解決了幾十年未曾解決的遺傳學(xué)刑事案件。然而,在這項(xiàng)研究中,它不是罪犯是未知的,而是受害者—即存在缺陷的基因---是未知的。”如今,Stainier團(tuán)隊(duì)與國(guó)際合作者一道成功地找到了這種基因。
隱藏在染色體末端的‘保護(hù)帽’中
Reischauer說(shuō),“由于Cloche基因位于13號(hào)染色體的最末端,也就是位于端粒區(qū)中,這就使得這種尋找非常復(fù)雜。”如今,利用只有最近才能使用的方法(比如,CRISPR/Cas9和TALEN),研究人員擁有分析這些區(qū)域的工具。Reischauer說(shuō),“此外,我們?cè)坏貌患僭O(shè)這種基因僅在血管生長(zhǎng)明顯缺乏的時(shí)間之前是有活性的。這就使得更難識(shí)別出存在缺陷的胚胎。”
在這項(xiàng)新的研究中,研究人員首先研究了他們猜測(cè)Cloche基因在基因組中所在的整個(gè)區(qū)域。通過(guò)分析26,000種基因的數(shù)據(jù),他們鑒定出17種基因可能是潛在的候選物。接著,他們通過(guò)產(chǎn)生基因敲除系(knockout line)分別地讓這17種基因失活,并研究了這些基因敲除系產(chǎn)生的胚胎中的血管生長(zhǎng)。Reischauer說(shuō),“僅在一種胚胎中,我們發(fā)現(xiàn)了期待的情形,也就是不能夠誘導(dǎo)血管生長(zhǎng)。這樣,我們才確信我們已找到Cloche基因?!?/p>
在進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)中,研究人員發(fā)現(xiàn)Cloche基因?qū)ε咛ブ械难芎脱?xì)胞產(chǎn)生是多么重要:經(jīng)證實(shí)之前已知參與血管形成的所有基因僅在Cloche基因有活性時(shí)才有活性。因此,Cloche基因本身控制著這整個(gè)遺傳程序的活性。
這種情形也在所謂的過(guò)表達(dá)實(shí)驗(yàn)中得到證實(shí),在這種實(shí)驗(yàn)中,研究人員將純的Cloche mRNA注射到胚胎中。這種方法能夠讓這些胚胎在它們發(fā)育期間的某個(gè)在正常情形下Cloche基因是沒(méi)有活性的時(shí)刻開(kāi)啟血管和血細(xì)胞形成程序。Stainier說(shuō),“因此,我們能夠提出我們發(fā)現(xiàn)負(fù)責(zé)控制這種發(fā)育程序的基因?!?/p>
Cloche基因似乎在自然界中是高度保守的:這種基因甚至也存在于鳥(niǎo)類(lèi)中。在哺乳動(dòng)物中,也存在一種密切相關(guān)的基因能夠接管這種斑馬魚(yú)模式生物中的Cloche基因功能。因此,研究人員假設(shè)“隨著鑒定出這種基因和它的功能,將有巨大的機(jī)會(huì)開(kāi)發(fā)出用于個(gè)人化干細(xì)胞治療的新應(yīng)用”。
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